此外，对检查中称“与环保部门联网的在线监测数据弄虚作假”，海正药业人士并不认同。“检测的表是由地方环保局统一安装维护的，公司根本没有权限去修改数据；现在运营维护部门已上门检修，承认是他们的问题。”
浙江台州是环保污染极其敏感的区域，此前几年当地环保部门已多次对当地原料药企业开出罚单与整改措施。2011年年中，记者在实地采访时曾发现，部分企业乱排废水与废气处理不力的现象仍难以禁绝。
在此次环保部披露的有涉环境违法案的12家企业中，原料药企业与精细化工企业占了绝大多数。湖北省潜江永安药业股份有限公司的1.4万吨酒精法环氧乙烷生产装置被查出未批先建，并已投入生产；且污水处理站排水长期超标排放，现场检查时弄虚作假。
对此，中国医药企业管理协会副会长于明德表示，未来5年药企的环保压力会越来越大，2013年，国家有关部门可能提前出台新的环保、排放要求，企业必须对此充分重视。他表示，制药企业必须进行绿色生产，优化工艺，采用先进的生物技术来取代一部分传统技术，以达到降低排放、减少环境污染的目标。